天下有很多人为王氏家族感到冤屈。谏大夫杨宣呈上密封奏章说：“孝成皇帝（汉成帝）深思宗庙社稷的重要，称赞陛下的至高品德以继承皇位，他的策略深远，恩德极为深厚。追念先帝的心意，难道不是想用陛下来代替自己，以便侍奉太皇太后（王政君）吗！太皇太后年已七十，屡经忧伤（成帝、哀帝父刘康皆早逝），敕令王氏亲属退避，让路给丁、傅家族（指王莽被遣就国），路上的行人都为之落泪，何况陛下呢！陛下登高远望时，难道不觉得在成帝的延陵前有愧吗！”哀帝深为他的话所感动，又封成都侯王商的次子王邑为成都侯。
朱博又上奏说：“汉朝旧制，设置部刺史，官秩低但奖赏丰厚，所以人人都努力立功，乐于进取。先前撤销刺史，改设州牧，官秩为真二千石，地位仅次于九卿；九卿职位空缺时，由政绩考核优秀者递补；其中才能中等的人则只求保全自己而已。恐怕这样下去，治理的功效会逐渐衰退，奸邪不法之事无法禁止。臣请求撤销州牧，依旧设置刺史。”哀帝听从了他的建议。六月，庚申日（六月初九），帝太后丁氏去世。哀帝下诏，将她的灵柩运回定陶安葬在共皇陵园，征发陈留、济阴两郡及附近封国五万人挖掘墓穴、填土筑坟。
当初，成帝时，齐人甘忠可假造《天官历》、《包元太平经》十二卷，说汉朝正逢天地的大终结，应当重新接受天命于天，并将此学说传授给渤海人夏贺良等。中垒校尉刘向（刘歆之父）上奏甘忠可假借鬼神，欺骗君主迷惑民众；甘忠可被关进监狱，审讯认罪；还未判决，就病死了。夏贺良等人仍私下互相传授。哀帝即位后，司隶校尉解光、骑都尉李寻举荐夏贺良等人，他们都在黄门（宫廷）等待皇帝召见。哀帝多次召见他们，夏贺良等人陈述说：“汉朝的国运已经中衰，应当重新接受天命。成帝不应天命，所以没有后嗣。如今陛下长期患病，灾异变异多次出现，这是上天在谴责警告人。应该赶紧更改年号和帝号，才能延年益寿，皇子降生，灾异平息。如果懂得这些道理却不实行，灾祸将无所不至，洪水将会涌出，火灾将要燃起，涤荡百姓。”哀帝久病不愈，希望这些做法能有效，于是听从了夏贺良等人的建议，下诏大赦天下，将建平二年（公元前5年）改为太初元年（元年号），自称“陈圣刘太平皇帝”，并将计时用的漏壶刻度由一百度改为一百二十度（象征新的开始）。
秋季，七月，哀帝将渭城（咸阳）西北原上的永陵亭地区定为自己的初陵（陵墓），不再迁徙郡国民众。
哀帝更改年号一个多月后，病情依然如故。夏贺良等人还想胡乱更改政事，大臣们争相反对，认为不能答应。夏贺良等人上奏说：“大臣们都不懂天命，应该罢免丞相、御史大夫，任用解光、李寻来辅佐朝政。”哀帝因为他们的预言没有应验，八月，下诏说：“待诏夏贺良等人建议更改年号帝号，增加漏刻，说是可以使国家永远安定。朕信道不够坚定，错误地听信了他们的话，希望能为百姓造福，但最终没有好的效验。有过错而不改正，这才是真正的过错！六月甲子日（六月初九）发布的诏书（指大赦改元等），除了大赦令外，其余措施全部废除。夏贺良等人违背正道，蛊惑民众，其奸邪行为应当彻底追究。”夏贺良等人都被关进监狱，处死。李寻和解光被减死罪一等，流放到敦煌郡。
哀帝因为久病不愈，把前代曾经兴建的祭祀各种神灵的祠庙共七百多所全部恢复，一年内进行三万七千次祭祀。
傅太后对傅喜怨恨不已，派孔乡侯傅晏暗示丞相朱博，让他上奏免除傅喜的侯爵。朱博与御史大夫赵玄商议此事，赵玄说：“事情以前已经裁决（指遣就国），现在再提，恐怕不合适吧？”朱博说：“我已经答应孔乡侯了。普通人之间的约定，尚且要拼死履行，何况是面对至尊（傅太后）！我朱博只有一死了！”赵玄随即同意。朱博不愿意单独弹劾傅喜一人，因为前大司空汜乡侯何武先前也因过失被免官遣回封国，情况与傅喜相似，就同时上奏：“傅喜、何武先前在位时，对治理国家都没有什么益处，虽然已被免职遣回封地，但保留爵位封地，也是不合适的。请求将他们一并免为平民。”哀帝知道傅太后一向怨恨傅喜，怀疑朱博、赵玄是秉承傅太后的旨意，立即召赵玄到尚书处询问情况，赵玄承认了。哀帝下诏：“左将军彭宣与朝中大臣一同审问此案”，彭宣等人上奏弹劾“朱博、赵玄、傅晏都犯了大逆不道、大不敬之罪，请求将他们召至廷尉诏狱（皇帝特设监狱）审问”。哀帝减轻赵玄死罪三等；削去傅晏封邑的四分之一；派谒者持节召丞相朱博到廷尉那里去，朱博自杀，封国被废除。
九月，任命光禄勋平当为御史大夫；冬季，十月，甲寅日（十月二十五日），升任平当为丞相；因为正值冬季（不宜封侯），暂且赐爵关内侯。任命京兆尹平陵人王喜为御史大夫。
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