永平四年（公元61年 辛酉年）
春天的时候，皇帝打算出门看看城里的宅邸，还想顺便去河内打猎。东平王刘苍知道后，赶紧上书劝阻。皇帝看了奏章，马上就回宫了。
秋天九月戊寅日，千乘哀王刘建去世，他没有儿子，封国就被朝廷收回了。
冬天十月乙卯日，司徒郭丹、司空冯鲂被免职，朝廷任命河南尹沛国人范迁为司徒，太仆伏恭为司空。伏恭是伏湛哥哥的儿子。
陵乡侯梁松因为心怀不满，还写匿名信诽谤他人，被关进监狱，最后死在狱中。当初，皇帝还是太子的时候，太中大夫郑兴的儿子郑众因为精通儒家经典很有名气。太子和山阳王刘荆就想通过梁松，用细绢和布帛做礼物，请郑众来辅佐。郑众拒绝说：“太子是国家未来的君主，按规矩不能和外界私下交往。汉朝一直有禁令，藩王也不应该私自结交宾客。”梁松劝他：“这是长辈的心意，不好拒绝。”郑众却坚持说：“我宁愿坚守正道而死，也不愿违反禁令犯罪。”最后没去。等到梁松获罪，他的很多宾客都受到牵连，只有郑众没被牵连进去。
于阗王广德率领各国三万士兵攻打莎车国，他用计骗来莎车王贤，把贤杀了，吞并了莎车国。匈奴得知后，发动其他国家的军队包围了于阗，广德没办法只好投降。匈奴就立了贤留在匈奴做人质的儿子不居征为莎车王。但没多久，广德又把不居征杀了，改立不居征的弟弟齐黎当莎车王。
东平王刘苍因为是皇帝的至亲，还帮忙处理朝政，声望越来越高，他心里很不安，前前后后多次上书说：“自从汉朝建立以来，皇室子弟就没有在朝廷公卿位置上任职的。我请求上交骠骑将军的印绶，回到自己的封国去。”言辞十分恳切，皇帝最后同意他回封国，但没让他上交将军印绶。
永平五年（公元62年 壬戌年）
春天二月庚戌日，刘苍辞去官职回到封国。皇帝任命骠骑长史为东平太傅，骠骑掾为中大夫，骠骑令史为王家郎，还额外赏赐了五千万钱和十万匹布。
冬天十月，皇帝到邺城巡视，当月就回宫了。
十一月，北匈奴侵犯五原郡；十二月，又侵犯云中郡。不过都被南单于带兵打退了。
这一年，朝廷把住在内地郡县的边民送回边境地区，还给每个人发了两万钱的安家费。
安丰戴侯窦融年纪大了，他的子孙却放纵荒诞，很多人做违法的事。窦融的长子窦穆娶了内黄公主，他假传阴太后的诏书，让六安侯刘盱休掉妻子，把自己的女儿嫁给刘盱。刘盱前妻的家人上书告发这件事，皇帝非常生气，把窦穆等人的官职全部罢免，窦氏家族里担任郎吏的人，都带着家属回到老家，只把窦融留在京城。窦融不久后就去世了。几年后，窦穆等人又因为犯法，和儿子窦勋、窦宣一起被关进监狱，最后死在狱中。过了很久，皇帝才下诏让窦融的夫人和一个小孙子回到洛阳居住。
永平六年（公元63年 癸亥年）
春天二月，王雒山发现了宝鼎，有人把它献给朝廷。夏天四月甲子日，皇帝下诏书说：“吉祥的征兆出现，是因为有德行的人。可现在国家治理还有很多问题，怎么会出现宝鼎呢？《易经》里说‘鼎象征三公’，难道是公卿大臣们尽职尽责才得到的吗？赏赐三公每人五十匹帛，九卿和二千石官员减半。先帝曾下诏禁止人们在上书时称皇帝为‘圣’，但最近奏章里很多浮夸不实的话。从现在起，如果再有过分夸赞、虚假称誉的内容，尚书一律扣下不呈报，让那些爱谄媚的人知道这样做没用。”
冬天十月，皇帝到鲁地巡视；十二月，又到阳城巡视；壬午日，回到宫中。
这一年，南单于适去世，单于莫的儿子苏继位，称丘除车林鞮单于。但才过几个月，苏也死了，单于适的弟弟长继位，称湖邪尸逐侯鞮单于。
永平七年（公元64年 甲子年）
春天正月癸卯日，皇太后阴氏去世。二月庚申日，安葬阴太后，谥号为光烈皇后。
当时北匈奴势力还很强，多次侵犯边境，他们派使者来请求和汉朝通商。皇帝希望通过和他们交往，让他们不再侵扰边境，就同意了。
朝廷任命东海相宋均为尚书令。当初，宋均担任九江太守时，五天处理一次政务，精简了很多属吏，还关闭了督邮府。这样一来，下属各县都太平无事，百姓安居乐业。九江以前常有老虎伤人，官府经常招募人设置陷阱捕虎，可还是有很多人被老虎伤害。宋均就给下属各县发文书说：“长江、淮河一带有猛兽，就像北方有鸡和猪一样平常。现在老虎成灾伤人，错在那些残暴的官吏。辛苦地捕捉老虎，不是解决问题的根本办法。大家要努力铲除奸邪贪婪的官吏，选拔忠诚善良的人。把捕虎的陷阱都撤掉，取消相关的考核制度。”从那以后，九江就再也没有老虎伤人的祸患了。皇帝听说了宋均的名声，所以让他担任重要的尚书令一职。宋均对人说：“国家喜欢那些精通法令条文的官吏和廉洁的官员，觉得这样就能制止奸邪之事。但那些官吏习惯了欺骗，廉洁的官员也只是自己清白，对解决百姓流亡、盗贼作乱这些问题没什么帮助。我想向皇帝进谏，可现在还不是时候。等以后问题严重了，才能说。”还没等他进谏，就调任司隶校尉了。后来皇帝听说了他这番话，觉得很有道理。
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