除了直接整顿生员士子们，教官、学官们也是极为重要的，他们是朝廷教育的主管官员，是直接和生员士子们接触的人，学风、士风首先就系于教官、学官的。
学部左侍郎吕坤就上疏称：“学校祖宗时所慎重，今天的教官徒取充位，不获实用，或聚之书院倡为讲学，有类该禅名为主静无异入定，圣如孔子犹曰博学于文，贤如颜回，子犹曰博我以文。今天的教官则以六经为糟粕，谓不立文字直可超悟，圣贤千言万语皆从心上说来，中和位育之功，皆自心上做出。今谓心亦不用曰不思善、不思恶，但看本来面目，说六经注我，非我注六经，其实是以佛老之似乱孔孟之真。”
士人的崇尚空谈，首先就是从这些德不配位的教官、学官们开始的，蔡国熙和吕坤认为造成这种现象的主要原因是教官的地位卑陋，缺员现象日益严重，而朝廷为了使得教官足数，就让一些德不配位的人充任教官，使得大明的士风由此败坏。除此之外，学官缺乏和素质低下也是一个很重要的问题，
为此，学部上疏称：“国家养士之本在学校，贞教端范在学臣。自我朝开国，教化日重，非贤才不轻授。且两京用御史，外省用按察司风宪官为之。师严而后道尊，道尊则民知敬学。近年以来，官员多不法，因而士习日敝，民伪日滋，以驰骛奔趋为良图，以剽窃渔猎为捷径，虽居常则德业无称，从仕则功能鲜效，祖宗专官造士之意，骎以沦失。”
现在对于大明的教育体系来说，教官和学官已经是到了必须要整顿的地步了，教官主要是选拔真才实学的人充当，同时要给予教官权力，能够有效的惩治这些生员，维护朝廷的法度，而对于学官，则是选拔德行高超，精明强干的官员充当。
学部在大明被认为是一个清水衙门，虽然有管理生员、教育的大权，但是受到地方各级官府等的掣肘，而地方的提学使司权力也极为有限，在这种情况下，不管是各地的提学使司还是各级学官等，都充斥着昏官、庸官，他们任德而不任怨，任逸而不任劳，若考察优劣犹关风励，一委教官，有预钻德行、规避下等，此通弊也！
所以，必须首先要整顿教官、学官，朱载坖下旨命令吏部和学部商量整顿教官和学官的相关事宜，其实朱载坖很清楚这其中的弊端，教官、学官们之所以懒散怠惰，主要是因为升迁无望，在仕途无望的情况下，他们自然就很难勤于公务了，转而想的是怎么利用自己手上的权力牟取私利了。
而署吏部事左侍郎赵志皋很快就向朱载坖上疏提出了自己的看法，他认为整顿教官、学官，除了要在选任的时候就加以慎择之外，更加重要的就是要明确升迁，对于能够贯彻朝廷意志的教官、学官，予以嘉奖升迁，怠惰的予以严惩。
这点得到了朱载坖的认同，根据吏部和学部的商量，制定了大明学政则例，其中严格规定了对于教官、学官的选拔任用和考核奖惩制度。
根据吏部所制定的则例：“教官、学官尤宜慎择其人，必得廉静恬退之士、有严重刚方之操者，而责之久任，寓风采于涵育，藉纲纪以作兴。俟其卓有成效，抚、按会举而授以京堂，斯为转移要法。学官则宜仿永乐年间例，单用一榜以上，一切乞恩与近例不及改教者，俱罢不行。在岁贡，须选年力强壮、品格纯雅者起送廷试选用。其龙钟老迈者，即为题授冠带，不必赴京希用，授职之后，不论举贡，俱以进德修业造士为先，而明经课文次之。”
而对于教官、学官的考核，也做了详细的规定：“三年一考，必择士心咸服、士习丕变者，抚、按会举再任；不称职者，即罢黜。六年再考，必择作人有效、成德几人、达才几人历历有据者，抚、按会举，举首俱授部寺京职。若有教范平常、无可称述者，举人酌授闲散外任、贡士致仕，不许更混师表。其硕德名贤，庶几如端如瑞两臣者，抚、按会举留任。俟其九年考满，悉按旧制起补翰林院编修及给事中等官。其直隶提学视外之提学，顺天、应天各府教官视外学一体遵行。”
这个制度朱载坖认为还是很不错的，主要就是解决了教官、学官的出身、选任和奖惩问题，首先教官、学官必须选择举人及以上功名的人，同时实施廷试制度，就是由内阁大学士主持，在翰林院进行考试，必须要达到一定的学术水平，才能够担任学官、教官。以此保证这些教官、学官的质量和学术水平。
除此之外，就是要严明考成，之前这些学官、教官之所以怠惰，主要就是因为仕途无望，之前被发配到教官、学官的，要么是大挑挑剩下的举人，要不然就是大计被弹劾的官员改任而来的，他们都是所谓被打入另册的官员，既然升迁无望，指望他们认真尽责也就是一个极为玄幻的事情了。
所以必须要严格奖惩，对于其中考绩优良的，不仅仅可以升任京官，更可以选入翰林院或者是诸科这样的实权或者是有升迁能力的部门，当然，对于仍旧玩忽懈怠者，也是要予以严惩的，该罢黜的罢黜，该冠带致仕的也要冠带致仕。
同时，国子监更是大明最高学府，更是要予以重视的，所以对于国子监官员，更是要专门予以规定：“南北国学，尤天下贤才所关。祭酒、司业务选一代儒宗、畀以斯任。博士、助教等官，或甲科初选，或学官升补。凡举人贡士，须令实实在监陶镕气质，涵养德性，讲明修己治人之学。监生则行积分旧制，如有异才粹品，亦仿永乐年间擢用监生吴信等例，俾翰林严试，拔其优者试之于翰苑，具名举荐。”
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